La lagune bordée de mangroves à Fajardo maintient des concentrations approchant un million d'organismes par gallon pendant les mois de pointe, une densité suffisamment rare pour qu'il n'existe que cinq véritables baies bioluminescentes dans le monde. Les scientifiques attribuent ce phénomène à un chenal peu profond et étroit reliant la lagune aux Caraïbes, qui piège les nutriments tout en limitant les échanges d'eau, ainsi qu'à la dense canopée de palétuviers rouges qui bloque la lumière ambiante et filtre les eaux de ruissellement.
La baie a obtenu un statut protégé en 1990 après que des décennies de tourisme non réglementé aient menacé son écosystème fragile. Aujourd'hui, le Département des ressources naturelles et environnementales de Porto Rico limite les visites nocturnes et impose l'utilisation d'embarcations non motorisées (kayaks et bateaux électriques) pour préserver la qualité de l'eau. L'industrie des visites de la baie bioluminescente de Laguna Grande opère sous des permis stricts, avec des guides formés à la navigation à faible impact et à la biologie marine. La plupart des visites en kayak de la baie bioluminescente de Laguna Grande partent de Las Croabas, pagayant sur un demi-mile à travers des tunnels de mangroves avant d'atteindre la lagune ouverte où la bioluminescence devient visible.
L'effet s'intensifie par nuit sans lune, lorsqu'un simple mouvement de la main dans l'eau laisse une traînée lumineuse et que les poissons dartant en dessous apparaissent comme des traits de feu froid. Les Pyrodinium bahamense génèrent de la lumière par une réaction chimique impliquant la luciférine et l'oxygène, un mécanisme de défense destiné à effrayer les prédateurs. Les organismes prospèrent dans des eaux chaudes et peu profondes à salinité stable, des conditions que la Laguna Grande maintient toute l'année grâce à sa configuration géologique. Les vents de force ouragan et les fortes précipitations atténuent temporairement la lueur en diluant la salinité et en remuant les sédiments, mais la population se rétablit en quelques semaines.
Rejoindre la baie bioluminescente de Laguna Grande depuis San Juan nécessite un trajet de quarante-cinq minutes vers l'est sur la Route 3, bien que de nombreux visiteurs combinent l'excursion nocturne avec une exploration diurne de la forêt tropicale d'El Yunque ou de la plage voisine de Seven Seas. L'emplacement de la baie sur la côte nord-est de Porto Rico la rend accessible depuis la plupart des hébergements de l'île, et la carte de la baie bioluminescente de Laguna Grande montre un accès clair via la marina de Las Croabas. Les discussions sur Reddit et les avis sur la baie bioluminescente de Laguna Grande décrivent systématiquement l'expérience comme féerique, bien que les voyageurs chevronnés recommandent de visiter pendant les phases de nouvelle lune et de programmer les visites pour les premiers créneaux de départ afin d'éviter la foule sur l'eau.
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